La primul etaj întâlnim Pictura Spaniolă din sec. XVII-XVIII, Pictura Flamandă din sec. XVII, Pictura Olandeză din sec. XVII, Pictura Franceză din sec. XVII şi Pictura Italiană din sec XVII. Opere de Velasquez, Rubens, Goya, Caravaggio şi Ribera... Este locul cel mai impresionant al muzeului, aceasta şi datorită modului de distribuire a tablourilor în cele peste 50 de încăperi aflate la acest etaj... Cel de-al doilea etaj cuprinde Pictura Spaniolă din sec. XVIII, Pictura Britanică din sec. XVIII, Pictura Franceză din sec XVIII, Pictura Germană din sec. XVIII, Pictura Italiană din sec. XVIII şi Sculptura.
Hieronymus Bosch, Gradina plăcerilor pământeşti, 1500
Desene şi lucrări de Goya şi Tiepolo... Expusă după criterii cronologice, pictura spaniolă este redată începând cu pictura murală romanică din sec. XII şi până la operele lui Goya din sec. XIX... la parter, împreună cu pictura medievală şi renascentistă, întâlnim picturile lui El Greco... Galeria centrală expune lucrări de Ribera şi Murillo iar în sala basilica şi sălile adiacente sunt expuse picturi de Velasquez şi Secolul de Aur, culminând cu operele lui Goya care sunt distribuite între acest etaj şi următorul... Pictura italiană are dedicate 16 săli de expoziţii unde putem admira lucrări de Fra Angelico, Mantegna, Botticelli, Tiepolo şi Giaquinto iar la parter operele lui Rafael şi cele ale şcolii veneţiene — Tiziano, Tintoretto, Verones şi Bassano... Pictura Flamandă şi olandeză este reprezentată de Weyden, Bouts, Memling şi El Bosco — la parter iar la etaj un important ansamblu de picturi realizate de Rubens, van Dyck şi Brueghel... Relaţiile spaniolo-franceze din sec. XVII şi achiziţiile unor regi cum ar fii Felipe IV şi Felipe V stau la baza colecţiei de pictură franceză găzduită în muzeul del Prado, cu lucrări de Poussin şi Claudio de Lorena la etajul principal şi de Ranc, van Loo sau Watteau la etajul secund. Pictura Germană este redusă din punct de vedere numeric dar de mare calitate prin colecţia de pictură cuprinzând lucrări din sec. XVI–XVIII... la parter, una dintre săli este dedicată lucrărilor capitale ale lui Alberto Durero, Lucas Cranach şi Baldung Grien... la etajul secund, altă sală este atribuită pictorului neoclasic Anton Rafael Mengs... Aduse din Italia între secolele XVI şi XIX, cele peste 220 opere de sculptură clasică din muzeul del Prado ilustrează perioade cuprinse începând cu arta arhaică greacă şi până la perioada elenistică şi lumea romană... Colecţia de sculptură este completată cu lucrări semnate de Leoni comandate pentru Carlos V şi Felipe II în sec XVI... În sălile muzeului sunt repartizate diverse obiecte de artă decorativă, ceramică, mese şi scaune de piatră, sculpturi de format mic... colecţia cea mai importantă este alcătuită de aşa numitul Tesoro del Delfin care a aparţinut lui Felipe V şi care este expusă la subsolul muzeului. Muzeul are în colecţia lui şi peste 4000 de desene — cele mai importante fiind desenele şi ilustraţiile purtând semnătura lui Goya...
Francisco de Goya, Lăptăreasa din Bordeaux, 1827
Calendarul expoziţional cuprinde următoarele titluri: Goya. La Tauromaquia – procesul creativ, expoziţie deschisă în perioada 10 octombrie 2002 – 7 ianuarie 2003; El Arte En La Corte De Felipe V – pictura, expoziţie dceschisă în perioada 30 octombrie 2002 – 26 ianuarie 2003; Carlos De Haes (1826 – 1898) – expoziţie deschisă între 15 octombrie 2002 şi 12 ianuarie 2003; Flores Espanolas Del Siglo De Oro – 15 noiembrie 2002 până în 2 februarie 2003; Vermer Y El Interior Holandes – 19 februarie 2003 – 18 mai 2003... şi cu asta basta! Adică ar mai fi o mulţime de lucruri de spus şi de descris, dar Don Quijote este încă sub efectul minunăţiilor văzute aşa că ar trebui să-l lăsăm să se odihnească vreo două trei sute de ani ca să poată povesti celor care vin toate peripeţiile lui în interiorul muzeului unde, dacă nu ai o hartă, rişti să te învârţi în cerc o zi întreagă şi să nu poţi vizita decât cel mult parterul...